2022-10-30 16:52:17 張磊 黃海瀛
10月7日，《Microbiome》在線發(fā)表了生命科學(xué)學(xué)院沈錫輝教授團(tuán)隊(duì)題為“Exploring AI-2-mediated interspecies communications within rumen microbial communities”的研究論文，揭示了瘤胃微生物菌群的群體感應(yīng)信號(hào)分子合成酶及受體基因的分布和表達(dá)規(guī)律，并構(gòu)建了群體感應(yīng)分子介導(dǎo)的瘤胃微生物種間交流網(wǎng)絡(luò)。生命科學(xué)學(xué)院博士生劉孝珍、劉欽萌為本論文共同第一作者，張磊教授和沈錫輝教授為本論文的共同通訊作者。
群體感應(yīng)(quorum sensing，QS)是細(xì)菌種內(nèi)和種間細(xì)胞間交流的普遍機(jī)制，通過(guò)合成和分泌稱為自誘導(dǎo)物(autoinducer)的信號(hào)分子監(jiān)測(cè)細(xì)菌群體密度的變化，協(xié)調(diào)細(xì)菌的群體行為。QS信號(hào)分子autoinducer-2 (AI-2)廣泛存在于細(xì)菌中，既能介導(dǎo)種內(nèi)交流，又能介導(dǎo)種間交流，被稱為“細(xì)菌的世界語(yǔ)”，但人們對(duì)細(xì)菌如何感知該QS信號(hào)知之甚少。2020年10月該課題組發(fā)現(xiàn)原核生物(包括細(xì)菌和古菌)通過(guò)一類具dCACHE結(jié)構(gòu)域的跨膜信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白感知AI-2信號(hào)實(shí)現(xiàn)異種細(xì)胞間對(duì)話的新機(jī)制(Zhang et al., Nature Communications, 2020)。
反芻動(dòng)物的瘤胃是一個(gè)天然發(fā)酵體系，依賴其中存在的大量不同種類的厭氧微生物聯(lián)合作用對(duì)木質(zhì)纖維素進(jìn)行降解和利用。目前對(duì)瘤胃微生物菌群的種間交流及協(xié)同作用機(jī)制知之甚少。本研究對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)中已有的瘤胃細(xì)菌完整基因組信息進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)QS合成酶基因存在于絕大多數(shù)瘤胃細(xì)菌中，尤其是AI-2合成酶基因存在于一半以上瘤胃細(xì)菌中，而AI-2受體編碼基因存在于超過(guò)1/3以上瘤胃細(xì)菌中，且尚有大量潛在AI-2受體編碼基因有待進(jìn)一步發(fā)掘。宏轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)瘤胃優(yōu)勢(shì)菌群中AI-2合成酶和受體基因均能高水平表達(dá)，表明AI-2介導(dǎo)的種間交流在瘤胃微生態(tài)系統(tǒng)中廣泛發(fā)生。瘤胃細(xì)菌中的dCACHE型AI-2受體包括甲基化趨化受體、組氨酸激酶、c-di-GMP合成與水解酶、絲氨酸磷酸酶、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶等跨膜信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白，表明AI-2信號(hào)可以調(diào)控瘤胃菌群的各種重要生理功能和群體行為?；谝陨习l(fā)現(xiàn)，我們進(jìn)一步構(gòu)建了AI-2介導(dǎo)的瘤胃微生物種間交流網(wǎng)絡(luò)。本研究極大促進(jìn)了對(duì)瘤胃微生態(tài)系統(tǒng)微生物種間交流機(jī)制的認(rèn)識(shí)，也為研究其他生境微生物群落成員之間的交流與協(xié)作機(jī)制提供重要參考。
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